جامعة الفاشر هي جامعة حكومية تقع في مدينة الفاشر، عاصمة ولاية شمال دارفور في السودان. تأسست الجامعة في نوفمبر 1975 بموجب المرسوم الجمهوري رقم (8) تحت اسم “جامعة دارفور”، لكنها بدأت عملها فعليًا في فبراير 1991 تحت اسم “الفاتح من سبتمبر”. بعد تقسيم دارفور إلى ثلاث ولايات عام 1993، أصبحت الكليات المتبقية في مدينة الفاشر نواة لجامعة الفاشر.

تعد الجامعة عضوًا في اتحادات الجامعات السودانية والعربية والإفريقية، ولها اتفاقيات تعاون أكاديمي وثقافي مع جامعات وطنية وإقليمية ودولية.